このキットは、中咽頭スワブ、鼻咽頭スワブ、喀痰を含む呼吸器検体中の新型コロナウイルス 2019-nCoV の ORF1ab/N/S 遺伝子を in vitro 定性的に検出し、同時に HV69-70 del の変異タイピングを実行するために使用されます。GISAID データベースで報告されているように、報告されている Omicron 変異体配列の 95% 以上に HV69-70 の欠失が含まれており、PCR アッセイで S 遺伝子標的不全 (SGTF) を引き起こす可能性があります。SGTF は、Omicron をスクリーニングするための代理マーカーとして使用できます。
プライマーセットとFAM標識プローブは、2019-nCoVのORF lab遺伝子、2019-nCoVのN遺伝子のVIC標識プローブ、2019-nCoVのS遺伝子HV69-70デル変異のROX標識プローブの特異的検出用に設計されています。試験サンプルと同時に抽出されたヒト RNase P 遺伝子は、核酸抽出手順と試薬の完全性を検証するための内部対照となります。ヒト RNase P 遺伝子をターゲットとするプローブは CY5 で標識されています。
リアルタイム PCR システム: Aehealth Diagenex AL、ABI 7500、ViiATM 7、Quant Studio 7 flex.Roche Lightcycler 480、Agilent Mx3000P/3005P、Rotor-GeneTM6000/0。Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P、MA 6000;